医院设有呼吸内科、消化内科、心脏介入科、肾脏内科、神经内科、内分泌科、感染性疾病科、风湿免疫科、肿瘤科、外一科、外二科、外三科、外五科、普外科、神经外科、胸外科、泌尿外科、皮肤科、骨一科、骨二科、骨三科、妇科、小儿骨科、小儿内分泌科、脂肪肝门诊、疝与腹壁外科诊疗中心、疝与腹壁外科、急诊科、重症医学科、眼科、耳鼻咽喉口腔科、口腔颌面外科、血液净化中心、中医内科、康复医学科、麻醉科、超声医学科、放射科、检验科、病理科、药剂科、中心实验室等临床科室和医技科室。
一、浙江省和杭州市市共建医学扶植重点学科：肾内科。
二、浙江省综合性医院示范中医学科：中西医结合骨伤科。
三、湖州市重点学科：肾内科、骨科、腹部微创外科、儿科、心血管介入中心。
四、湖州市医学重点支撑学科：普通外科学、骨外科学、泌尿外科学、肾脏病学、急诊医学、麻醉学。
五、湖州市优先发展重点学科：血管外科、眼科、口腔科、儿科、康复医学科、护理学。
一、优势病种：急性重症胰腺炎、腹型过敏性紫癜、肥胖症、矮小症、生长发育迟缓症、性早熟、胃癌、结肠癌、直肠癌、寻常疣、跖疣、丝状疣、尖锐湿疣、切口疝、腹股沟疝、闭孔疝、重型颅脑损伤、半球肿瘤、自发性脑出血、慢性顽固性便秘、门脉高压、食管裂孔疝、贲门失驰缓、急性白血病、脑卒中、脑外伤、肢体瘫痪、帕金森综合征、老年性痴呆、脊髓炎、小儿脑瘫、孤独症、脑发育迟缓、各种脑炎、颈椎病、腰椎间盘突出、背部筋膜炎。
二、优势技术：腹腔镜胆囊切除术、腹腔镜下灌洗引流术、肝囊肿开窗引流、腹腔镜下胃折叠减肥术、胃十二指肠穿孔修补术、血液灌流技术、心内电生理及射频消融术、先天性心脏病封堵术、二尖瓣球囊扩张术、甲状腺癌标准根治术、甲状腺癌联合根治术、强脉冲光美容治疗、CO2点阵激光、外周血干细胞移植治疗急性白血病、消化道息肉治疗术、内镜下止血术、支架置放术、神经肌肉促通术、关节松动术。
